羽毛布団と羽毛掛け布団は違いますか?

どちらも同じものです。
「布団」には「掛け布団」と「敷き布団」があるため、単に「布団」と言ってしまうと、どちらを意味しているかわからなくなることがあります。
例えば「綿布団」と言った場合は、掛け布団のことなのか、敷き布団のことなのかわかりません。
羽毛は綿と違い敷き布団に使われることがほとんどないため、「羽毛布団」といえば「羽毛の掛け布団」を意味します。
販売時などに「掛け布団」であることを強調する場合は「羽毛掛け布団」と呼ぶこともあります。
「羽毛布団」も「羽毛掛け布団」も、どちらも「羽毛を使った掛け布団」という意味で使われていますので、購入時に迷わないよう知っておくと良いですね。